Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms