Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms