Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IhhP97812 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IhhP97812 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IhhP97812 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IhhP97812 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IhhP97812 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms