Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cry1P97784 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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