Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas2P97460 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npas2P97460 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npas2P97460 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npas2P97460 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms