Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smyd1P97443 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms