Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mesp1P97309 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms