Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim43cP86449 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim43cP86449 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43cP86449 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43cP86449 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43cP86449 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43cP86449 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43cP86449 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43cP86449 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43cP86449 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43cP86449 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trim43cP86449 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim43cP86449 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trim43cP86449 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trim43cP86449 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trim43cP86449 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Trim43cP86449 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trim43cP86449 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trim43cP86449 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43cP86449 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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