Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tubg1P83887 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms