Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Usp9xP70398 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Usp9xP70398 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Usp9xP70398 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Usp9xP70398 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Usp9xP70398 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Usp9xP70398 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Usp9xP70398 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Usp9xP70398 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Usp9xP70398 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Usp9xP70398 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9xP70398 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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