Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms