Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms