Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Hoxd13P70217 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Hoxd13P70217 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hoxd13P70217 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hoxd13P70217 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hoxd13P70217 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hoxd13P70217 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hoxd13P70217 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Hoxd13P70217 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Hoxd13P70217 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Hoxd13P70217 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Hoxd13P70217 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hoxd13P70217 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hoxd13P70217 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hoxd13P70217 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hoxd13P70217 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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