Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rps3P62908 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps3P62908 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms