Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms