Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl18aP62717 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl18aP62717 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms