Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Snrpd1P62315 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Snrpd1P62315 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
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Snrpd1P62315 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snrpd1P62315 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snrpd1P62315 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snrpd1P62315 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snrpd1P62315 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snrpd1P62315 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snrpd1P62315 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snrpd1P62315 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Snrpd1P62315 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Snrpd1P62315 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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