Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Vbp1P61759 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Vbp1P61759 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Vbp1P61759 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Vbp1P61759 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Vbp1P61759 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Vbp1P61759 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vbp1P61759 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Vbp1P61759 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vbp1P61759 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vbp1P61759 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vbp1P61759 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Vbp1P61759 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vbp1P61759 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vbp1P61759 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vbp1P61759 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vbp1P61759 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Vbp1P61759 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Vbp1P61759 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Vbp1P61759 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Vbp1P61759 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vbp1P61759 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vbp1P61759 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vbp1P61759 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vbp1P61759 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vbp1P61759 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms