Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2fP61219 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2fP61219 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms