Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scarf2P59222 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scarf2P59222 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms