Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms