Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms