Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtpaP58389 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtpaP58389 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PtpaP58389 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtpaP58389 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PtpaP58389 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtpaP58389 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PtpaP58389 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PtpaP58389 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PtpaP58389 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtpaP58389 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtpaP58389 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtpaP58389 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms