Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms