Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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NcstnP57716 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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NcstnP57716 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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NcstnP57716 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcstnP57716 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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NcstnP57716 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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NcstnP57716 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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NcstnP57716 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NcstnP57716 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms