Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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Usp25P57080 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp25P57080 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp25P57080 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp25P57080 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp25P57080 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp25P57080 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp25P57080 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Usp25P57080 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Usp25P57080 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Usp25P57080 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Usp25P57080 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp25P57080 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms