Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SmoP56726 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SmoP56726 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SmoP56726 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SmoP56726 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SmoP56726 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SmoP56726 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SmoP56726 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmoP56726 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmoP56726 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SmoP56726 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmoP56726 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmoP56726 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmoP56726 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmoP56726 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmoP56726 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmoP56726 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmoP56726 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmoP56726 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmoP56726 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmoP56726 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmoP56726 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmoP56726 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmoP56726 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmoP56726 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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