Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp1P56183 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms