Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NcanP55066 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcanP55066 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcanP55066 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcanP55066 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcanP55066 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcanP55066 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcanP55066 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcanP55066 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcanP55066 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcanP55066 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcanP55066 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcanP55066 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NcanP55066 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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NcanP55066 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcanP55066 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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NcanP55066 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcanP55066 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcanP55066 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcanP55066 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcanP55066 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcanP55066 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcanP55066 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcanP55066 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NcanP55066 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NcanP55066 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NcanP55066 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NcanP55066 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NcanP55066 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NcanP55066 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NcanP55066 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NcanP55066 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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NcanP55066 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcanP55066 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcanP55066 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcanP55066 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcanP55066 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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NcanP55066 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NcanP55066 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcanP55066 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcanP55066 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NcanP55066 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NcanP55066 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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NcanP55066 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcanP55066 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcanP55066 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcanP55066 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcanP55066 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcanP55066 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NcanP55066 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NcanP55066 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcanP55066 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcanP55066 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcanP55066 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcanP55066 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NcanP55066 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NcanP55066 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NcanP55066 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NcanP55066 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NcanP55066 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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