Protein–RNA interactions for Protein: P54227

Stmn1, Stathmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmn1P54227 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmn1P54227 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms