Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TubP50586 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TubP50586 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TubP50586 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TubP50586 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TubP50586 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TubP50586 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TubP50586 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TubP50586 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TubP50586 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TubP50586 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TubP50586 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TubP50586 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TubP50586 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TubP50586 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TubP50586 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TubP50586 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TubP50586 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TubP50586 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TubP50586 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TubP50586 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TubP50586 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TubP50586 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TubP50586 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TubP50586 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TubP50586 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TubP50586 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TubP50586 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TubP50586 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TubP50586 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TubP50586 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TubP50586 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TubP50586 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms