Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpdP50404 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpdP50404 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms