Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtpreP49446 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpreP49446 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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