Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GdnfP48540 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GdnfP48540 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GdnfP48540 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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