Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms