Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc2P43407 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms