Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PpargP37238 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PpargP37238 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PpargP37238 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PpargP37238 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PpargP37238 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PpargP37238 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PpargP37238 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PpargP37238 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PpargP37238 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PpargP37238 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PpargP37238 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PpargP37238 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PpargP37238 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PpargP37238 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PpargP37238 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PpargP37238 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PpargP37238 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PpargP37238 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PpargP37238 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PpargP37238 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PpargP37238 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PpargP37238 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PpargP37238 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PpargP37238 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PpargP37238 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PpargP37238 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PpargP37238 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PpargP37238 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PpargP37238 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PpargP37238 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PpargP37238 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PpargP37238 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PpargP37238 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PpargP37238 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PpargP37238 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PpargP37238 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PpargP37238 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PpargP37238 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PpargP37238 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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