Protein–RNA interactions for Protein: P35441

Thbs1, Thrombospondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1P35441 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thbs1P35441 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thbs1P35441 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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