Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin1P35438 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms