Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TpoP35419 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TpoP35419 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TpoP35419 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms