Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab20P35295 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab20P35295 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab20P35295 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab20P35295 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms