Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa2P31245 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms