Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd1P30999 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms