Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif5cP28738 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms