Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RxrgP28705 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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