Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrbP28704 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxrbP28704 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RxrbP28704 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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