Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RxraP28700 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RxraP28700 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RxraP28700 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RxraP28700 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RxraP28700 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RxraP28700 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RxraP28700 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RxraP28700 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxraP28700 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxraP28700 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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