Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CftrP26361 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CftrP26361 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CftrP26361 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CftrP26361 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CftrP26361 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CftrP26361 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CftrP26361 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CftrP26361 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CftrP26361 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CftrP26361 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CftrP26361 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CftrP26361 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CftrP26361 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CftrP26361 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CftrP26361 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CftrP26361 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CftrP26361 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CftrP26361 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CftrP26361 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CftrP26361 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CftrP26361 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CftrP26361 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CftrP26361 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CftrP26361 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CftrP26361 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CftrP26361 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CftrP26361 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CftrP26361 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CftrP26361 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CftrP26361 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CftrP26361 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CftrP26361 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CftrP26361 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CftrP26361 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CftrP26361 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CftrP26361 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CftrP26361 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CftrP26361 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CftrP26361 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CftrP26361 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CftrP26361 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CftrP26361 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CftrP26361 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CftrP26361 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CftrP26361 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CftrP26361 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CftrP26361 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CftrP26361 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CftrP26361 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CftrP26361 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CftrP26361 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CftrP26361 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CftrP26361 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CftrP26361 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CftrP26361 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CftrP26361 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CftrP26361 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CftrP26361 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CftrP26361 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CftrP26361 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CftrP26361 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CftrP26361 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CftrP26361 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CftrP26361 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CftrP26361 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CftrP26361 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CftrP26361 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CftrP26361 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CftrP26361 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CftrP26361 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CftrP26361 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CftrP26361 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CftrP26361 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms