Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms