Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms